Cuộc phiêu lưu tiếp tục khi Go và Satoshi tiến xa hơn trên hành trình nghiên cứu và Go tham gia Dự án Mew. Nhưng Mew không phải là Pokémon Huyền Thoại duy nhất!

Nhà huấn luyện trẻ tuổi Satoshi và người bạn mới Go trở thành nghiên cứu sinh tại phòng nghiên cứu của Giáo sư Sakuragi. Họ đi khắp thế giới để tìm hiểu về Pokémon.